明黄河纂。明刊本。日本大阪府立圖書館藏。五册（分册流水號從181380至181384）。書號：692-13。版框約高19.8釐米，寬12.4釐米。每半葉十行，行二十字。白口，上黑魚尾，左右雙邊。魚尾下有“正卷”或“全卷”字樣，下爲頁碼。首爲楊府“序”，無撰序年。次爲“醫學會源”（目次）。次爲“湯散歌括目録”，下署“餘姚星陽黄河纂次”。次爲正文，分正卷、全卷兩卷。正卷之首未題書名，僅“正卷”二字，署名爲“勾餘星陽黄河纂，當湖友渠陸堯臣校”。全卷之首亦未題書名，僅載“湯散歌括”四字。

       該書責任人署名、分卷、内容，乃至版式、字體筆畫、斷版等均同前《醫學彙纂濟世丹砂》，可認定二書實出同版。其不同者，此本無扉頁，刊刻堂號不明。“正卷”僅目録題書名“醫學會源”、“全卷”首爲篇名“湯散歌括”。又正卷署名籍貫作“勾餘”而非“餘姚”。又此本將全卷目録移到正卷目録之後。然此諸多小異，不足以説明此本乃另版。據字畫粗細、斷版缺口等，《醫學會源》似爲初印本。此本書名、編次均不如《濟世丹砂》嚴謹，故疑《濟世丹砂》乃就《醫學會源》原版再加修潤者。

       今影印底本乃複印自日本大阪府立圖書館。該本原屬私立石崎文庫舊藏。石崎文庫於明治二十三年（1890）由石崎勝藏創立於奈良。石崎氏曾隨京都醫家福井貞憲學習漢方醫，明治時親歷日本漢方醫所遭厄運，深爲痛惜。乃逆時而動，從大阪書肆、京都醫家廣購古籍。至昭和二十六年（1951）該文庫移歸大阪府立圖書館時，圖書已達二千一百三十八部，一萬餘册，其中漢醫藥書占五百十五部，二千五百二十三册。（王鐵策：《醫學會源》解題，見《日本現存中國散逸古醫籍的研究與整理<1998年階段報告書>》，内部印行，北京：中國中醫研究院中國醫史文獻研究所，1998年，第30—31頁。其中數據援引自小曾户洋：《明代の醫藥書その4》，《現代東洋醫學》，1992年第13卷第4期，“後記”，第1—2頁）此本藏日本關西地區，故日本《醫籍考》未能著録。原本每册封皮爲燙花黄色彩紙，書中有閲覽者朱筆句讀，框上時有手書分類符號等。