清史以甲輯注。日本江户時期抄本（底本爲康熙十七年序，美延堂藏板）。日本國立公文書館内閣文庫藏。三册。書號：303-212。抄本高22.8釐米，寬14.4釐米。每半葉十行，行二十二字。無邊框行格。書前仿抄底本扉頁，上書“江都史子仁輯注/寒科正宗/一釋仲景原文/一輯諸賢方論/美延堂藏板”。首爲魏曰祁“序”、周斯“傷寒正宗叙”、康熙十七年（1678）史以甲“傷寒正宗序”。次爲凡例、目録。次爲正文，卷一之首題署爲“傷寒正宗卷之一/長沙太守張仲景方論，學圃老人史以甲輯注”。

       史以甲，字子仁，號學圃老人，江都（今江蘇揚州）人。少習儒，博學嗜古，旁通諸子百家之説。因侍其父疾，時嘗藥辨方，尤究心岐黄之術。曾得明醫袁秦郵之教。其父亡，遂棄舉子業，專於醫學三十餘年。謂張仲景方論實爲正宗，遂彙諸子之説，折衷《内經》，爲之詁讀，因撰《傷寒正宗》八卷（1678）。

       該書前三卷釋張仲景《傷寒論》，後四卷取諸賢之論以翼仲景。前三卷將仲景原文分作十篇，又合病七篇，並將“非仲景言”（如所謂王叔和序例）剔去，於仲景原文間時夾注以明其義，或引成無己等名家注釋於其中。卷四爲傷寒傳變、立法、辨證及診察等目，集取後世諸家之論。卷五以後爲“證治方論”，以傷寒諸證爲綱，集後世諸家之論以釋其病因病機。部分病證之後列出後世常用之方，間或附有方論。全書録方二百餘，采方論二十二家。卷八之末附“傷寒脉法指掌”，采自《仁齋直指方》。

       該書不見於國内清代書目著録。日本《醫籍考》著録此書，且載其凡例及周斯序節文。民國間孫殿起《販書偶記》載“《傷寒正宗》八卷，史以申撰，康熙庚申（1680）刊”。（孫殿起録：《販書偶記》，上海：上海古籍出版社，1982年，第229頁）其中“史以申”當爲“史以甲”之誤。該書明確記載康熙庚申刊，疑作者所見之本有刊刻牌記。今《中國中醫古籍總目》載該書兩部，一爲康熙十七年刻本，一爲據日本寫本複製本（題《傷寒正印》）。（薛清録主編：《中國中醫古籍總目》，上海：上海辭書出版社，2007年，第61頁）所謂“康熙十七年刻”，當據作序之年。不載堂號，疑脱扉頁。該本卷四缺“四時不同”一節。據其行款，似爲今影印日抄本之底本。另日本寫本複製本，實即今影印日抄本，然誤注其名爲“傷寒正印”。今影印底本爲江户抄本，每册之前有藏書印四方：“多紀氏藏書印”、“躋壽殿書籍記”、“醫學圖書”、“日本政府圖書”。前三印表明該書原藏明和二年（1765）多紀氏所創躋壽館。該館於寬政三年（1791）轉爲江户幕府官辦醫學館。後一印乃明治間該館圖書轉藏内閣文庫時所鈐。